常用的统计方法见下表所示。 […] Mann-Whitney-Wilcoxon检验也被称为Wilcoxon检验。 In statistics, the Mann–Whitney U test (also called the Mann–Whitney–Wilcoxon (MWW), Wilcoxon rank-sum test, or Wilcoxon–Mann–Whitney … 阅读全文 →

昨天遇到一个怪事，同一个 Git 目录，使用 Git Shell 时，可以直接 Push；而在 RStudio 中 push 时，则会请求输入账户名和密码。 在 Google 中以 “Rstudio git push need username” 搜索，在第三条结果的第三个高票回答中找到了解决方法。 git remote show origin # Push URL: … 阅读全文 →

因为“包治百病”，所以每个人都会到需要写包的时候。作为一个讲原则的开发者，Hadley Wickham 的写包指南还是要看一下的。写包，“so easy！” […] # 在指定路径创建一个包的骨架，包括文件夹结构和配置文件 create_package("~/path/to/foofactors") # 初始化 git use_git() # 在 R 目录下面新建 … 阅读全文 →

这个错误有点怪怪的。打开rmarkdown脚本运行时，会一直出现Error: option error has NULL value的提示，电脑基本也会卡死。 这个错误是在从R 3.5升级到3.6之后出现的。 其解决方法也很简单，就是升级RStudio软件。不过，发行版的RStudio软件并没有解决这个问题，需要使用preview版本的。 Preview版本的链接有点不大好找，在这 … 阅读全文 →

𝕂eep on as you have begun, and make all possible haste, so that you may have longer enjoyment of an improved mind, one that is at peace with itself. Doubtless you will derive enjoyment during the time … 阅读全文 →

本文曾经发表在 biobabble 微信公众号 链接 ggplot在绘制label的时候很容易出现字体溢出，位置难以调整的问题。Y叔曾经在公众号上吐槽过。 实际上，标签如何在图片中展示，还真不是一个简单的问题。有一个领域“Automatic label placement”就是研究该问题的。 下面介绍一下如何处理这个标签定位的问题。 […] 我们从mpg数据集中提取10行数据画图，默 … 阅读全文 →

𝕋ibble 和 Data.frame 一般可以通用，但是 Tibble 中含有的分组信息，如果不注意，有时可能会引起错误。 […] > error_rate_summary # A tibble: 81 x 8 # Groups: enzyme, nps [27] id enzyme nps rep type Error_Rate mean std <fct> … 阅读全文 →

本文是我在华中农业大学JC Bioinformatics 2018暑期生物信息学培训班上的讲义 […] 原核转录组课程讲授利用RNA-seq方法研究细菌基因组中基因表达差异的原理和方法。课程中不仅介绍了RNA-seq生物信息学分析的内容，还对RNA-seq的原理、文库构建等湿实验进行解读。 为了降低学习门槛，课程中的实例取自公开发表的细菌基因组，但是这不意味着相关原理和方法不能应用于 … 阅读全文 →

服务器网页显示：内部错误500，在日志文件中：/var/log/apache2/error.log提示以下错误： Invalid command 'php_value', perhaps misspelled or defined by a module not included in the server configuration Google了半天，没有查到可用的解决方案。考虑到之前做了服务 … 阅读全文 →

腾讯云开发平台几大优势： […] 对于已有的Git项目，可以通过下列途径关联。 # 首先在服务器控制面板创建一个同名项目 # 参考这里：https://dev.tencent.com/help/git-import-tencentcloud # 事实上，不用这么麻烦 git remote rm origin git remote add origin … 阅读全文 →