进化树

MEGA6: Constructing a Phylogenetic Tree on Multiple Sequences

2016-01-19 gaoch
使用BioEdit生成和绘制蛋白质进化树 虽然方法简单、上手快,但是由于 BioEdit 功能有限,使用起来很不方便。如果经常进行类似分析,那还是要使用 MEGA 6 这一个系统进化分析的“大杀器”。 第一步:下载和安装 MEGA 6。各平台均有发行版,在此不再赘述。 第二步:多序列比对,这是构建系统进化树的必要条件。 点击第一个按钮,选择 Edit/Build Alignment。 正如题目所说 … 阅读全文 →

使用BioEdit生成和绘制蛋白质进化树

2011-07-20 gaoch
𝔹ioEdit是一个功能很强大的生物学软件,整合了很多常用的生物信息工具。如:多序列比对,质粒图谱的绘制,查看DNA序列的酶切位点等等。 使用BioEdit可以方便的生成和绘制进化树。(另请参考:进化树大杀器MEGA的使用) 首先,打开序列。我们这里是一个含有6个蛋白质的Fasta格式的文件。如下所示: 然后从菜单中选择“ClustalW多序列比对”,会弹出下一个对话框,设置一些程序运行的参数。 … 阅读全文 →